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Sethenès

Coronavirus ... des graphiques

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Je suis la situation très régulièrement et j'ai fait mes propres Excel.

En bleu, la province du Hubei, en orange toutes les autres provinces réunies et en vert tout ce qui se passe hors de Chine (note : Macau, Taiwan et Hing Kong sont comptées comme "chinoises").

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Ce qu'on peut observer, c'est que le nombre de patients guéris (graphe du milieu) dans toutes les autres provinces (2800) est proche de celui de la seule province de Hubei (3400) pour un total de 6208 guéris en Chine.

A droite, on peut voir que le nombre de décès en dehors du Hubei est à ce jour très très faible alors qu'il semble que (graphe de gauche) la contamination n'explose pas dans ces provinces.

Evidemment, il faut relativiser les chiffres chinois mais si on compare ce qui se passe hors de Chine avec ce qui se passe en chine hors de Hubei, on a quand même des comportements similaires.

Hors de Chine : 448 cas confirmés, 68 guérisons (15%), 2 décès (0,5%)
En Chine hors de Hubei : 11700 cas confirmés, 2800 guéris (24%), 58 décès (0,5%).

Donc, certes, on ne peut pas arguer du taux de létalité final mais tout laisse à penser que tant que le système sanitaire tient, la situation reste sous contrôle.

 

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il y a 19 minutes, pehache a dit :

Je ne dis pas qu'il ne faut pas être prudent, ni que je détiens la vérité. Je dis simplement que ces graphiques rendent certains scénarios moins probables que d'autres.

Après, je peux comprendre qu'on choisisse de ne pas extrapoler "parce que cela n'a pas de sens". Moi je choisis de quand même le faire. Libre à chacun de faire ses propres interprétations ou pas.

Et depuis que je suis les chiffres (soit à peu près 20 jours), l'évolution va exactement dans la direction que j'ai pressenti mi-janvier déjà. Il y a 10 jours sur d'autres forums certains tenaient le même discours que toi, discours que je ne conteste pas sur le fond. Toujours est-il que 10 jours plus tard ma première impression (basée sur les chiffres) est toujours la bonne : tant que le système sanitaire tient, la situation n'est pas catastrophique (ce que les chiffres semblent confirmer).

J'ajoute que je regarde systématiquement les débats de C dans l'air à ce propos. Bien sûr, on peut rire de la qualité de la source mais ... voici la liste des intervenants ... ce ne sont quand même pas des seconds couteaux :

  • Emission des 3 dernières semaines :
    Coronavirus : pourquoi l'OMS s'inquiète 10.02.20 avec (entre autre) Daniel Levy-Bruhl, épidémiologiste – Santé publique France
    Virus : la Chine dit-elle toute la vérité ? 07.02.20 (économistes uniquement)
    Le monde se barricade, le virus se propage 03.02.2019 avec Astrid Vabret, cheffe de service de virologie au CHU de Caen et Vincent Enouf, virologue à l’Institut Pasteur
    Coronavirus, grippe : la France en alerte 01.02.2020 (pas de liste)
    Chine : l'empire vacille 29.01.2020 avec Marie-Paule Kieny, directrice de recherches à l’INSERM et ancienne sous-directrice générale de l’OMS
    Virus : "Situation grave" en Chine, premiers cas en France 25.01.2020 avec Arnaud FONTANET, directeur de l’Unité d’épidémiologie des maladies émergentes à l’Institut Pasteur et Anne GOFFARD, chercheuse et médecin, CHU de Lille.
    le virus qui inquiète le monde 22.01.2020 avec :
    • Anne Goffard, chercheuse et médecin, CHU de Lille.
    • Daniel Lévy-Brühl, épidémiologiste à Santé Publique France.
    • Sophie Matheron, médecin-clinicienne, spécialiste des maladies infectieuses à l’Hôpital Bichat à Paris.
Edited by Sethenès

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Selon tes propres chiffres, la mortalité dans la province d'origine est de l'ordre de 10%. Elle ne peut que grimper, et il n'y a aucune "chance" que la mortalité dans le reste de la Chine et dans le monde ne dépasse pas largement les 0.5% que tu calcules actuellement. On est en dessous du taux de mortalité du SRAS, mais le virus est plus contagieux. Sans dire qu'il faille paniquer, on ne peut que se dire que les mesures de quarantaine, d'isolement, et de restriction des déplacements, sont amplement justifiées.

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il y a 7 minutes, pehache a dit :

 Sans dire qu'il faille paniquer, on ne peut que se dire que les mesures de quarantaine, d'isolement, et de restriction des déplacements, sont amplement justifiées.

Mais où ai-je laissé entendre le contraire ? Tu lis dans mes propos des choses que je ne dis pas.

Ecrire que "tant que le système sanitaire tient, la situation reste sous contrôle" n'est pas un appel à relâcher la vigilance ... au contraire même ... si on y réfléchi bien.

 

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Ben en fait j'ai un peu de mal à voir où tu veux en venir avec ces chiffres... "tant que le système sanitaire tient, la situation reste sous contrôle" c'est une tautologie, non ?

Edited by pehache

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Il y a 3 heures, pehache a dit :

Ben en fait j'ai un peu de mal à voir où tu veux en venir avec ces chiffres... "tant que le système sanitaire tient, la situation reste sous contrôle" c'est une tautologie, non ?

Pas du tout, non. Prends le cas d'Ebola par exemple. Même avec un système sanitaire qui tient, la mortalité reste très élevée.

C'est bien là le problème de cette épidémie-ci, c'est que la mortalité au Hubei (1310 décès, hier sur 48206 cas, soit 2,72%) masque les chiffres des autres provinces et du reste du monde qui eux, sont bien inférieurs à cela.

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La mortalité d'Ebola est élevée, mais comme le virus n'est pas très contagieux les épidémies sont faciles à endiguer (dans un pays développé Ebola n'est pas plus une menace que le Choléra). Ce qui fait que le système sanitaire va "tenir" ou pas c'est la capacité à contenir l'épidémie et donc la facilité ou pas de transmission du virus. Avec le coronavirus j'ai l'impression qu'on est dans une zone orange, il faut prendre des mesures drastiques pour contenir l'épidémie.

Les chiffres de mortalité ailleurs que le Hubei ne sont pour moi pas très significatifs à ce stade.

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Avec le recul, je crois mieux comprendre la stratégie chinoise : isolement total des populations, interdiction des contacts, et on attends quinze jours pour que les personnes non infectées soient parfaitement sûres. Arrêt des nouveaux cas = arrêt de la propagation du virus.

La stratégie échoue dans le cas du paquebot Diamond Princess : le confinement des passagers n'a fait qu'augmenter les nombres de cas.

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il y a 59 minutes, pim a dit :

Avec le recul, je crois mieux comprendre la stratégie chinoise : isolement total des populations, interdiction des contacts, et on attends quinze jours pour que les personnes non infectées soient parfaitement sûres. Arrêt des nouveaux cas = arrêt de la propagation du virus.

La stratégie échoue dans le cas du paquebot Diamond Princess : le confinement des passagers n'a fait qu'augmenter les nombres de cas.

Oui, encore qu'il n'y a aucune autre méthode et donc qu'ils n'ont pas trop le choix. Ceci dit, il faut reconnaître une certaine efficacité à la méthode.

Logiquement, la progression d'une telle épidémie est exponentielle. Imaginons qu'un patient en infecte 2, à la 10ème générations, il y a donc 1023 ... cas.

Or ici, grâce à toutes ces mesures, il y a bien une progression mais elle n'est "que" géométrique soit en x^2. A la 10ème génération, il n'y a donc que 100 cas.

J'ai fait une simulation pour mieux se rendre compte des choses. En bleu, la courbe réelle et en orange une exponentielle. Je précise que l'exponentielle, je l'ai obtenue par essai/erreur jusqu'à ce qu'elle "singe" au mieux le comportement des premiers jours. Par contre, la ligne en pointillé bleu (ainsi que l'équation et le R^2) sont bien calculées par Excel (trendline).

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Aujourd'hui, ce à quoi il faut être attentif, c'est la situation au Japon mais surtout à Singapour. Le 14, il y 58 cas et deux jours plus tard, il y en a déjà 72.

Si dans les autres provinces, la mortalité croit très légèrement (ce qui est logique), elle ne décolle heureusement pas avec toujours "seulement" 74 morts hors Hubei (toutes les autres provinces + tous les autres pays touchés) alors que dans le même temps, il y a déjà (hors du Hubei toujours) 4234 patients guéris.

Corona5.thumb.PNG.eea493db66269e2d43149f5035c881ab.PNG

J'ai ajouté les éléments suivants :
1) la série des cas sévères, qui eux ne font que croître. Malheureusement, je n'ai cette information que pour la Chine et encore dans son ensemble. Je ne peux donc pas discriminer dans et hors Hubei.
2) J'ai ajouté un graphique avec les cas en traitement (autrement dit, le total moins les décès et les guéris). Comme on peut le voir, il y a un reflux hors du Hubei. Par contre, à l'international (en vert pointillé) les chiffres augmentent.

Edited by Sethenès

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